Europa
- Leitfaden zum strengen Schutzsystem für Tierarten von gemeinschaftlichem Interesse im Rahmen der FFH-Richtlinie 92/43/EWG (Februar 2007)
- Auslegungsleitfaden zu Artikel 6 Absatz 4 der Habitat-Richtlinie 92/43/EWG (Januar 2007)
- Interpretation Manual of European Union Habitats (EUR 27) (englisch, Juli 2007)
- Reporting under Article 17 – Annexes of DOCHAB 04-03/03-REV.3 und deutsche Übersetzung
- Natura 2000 und der Wald: Herausforderungen und Chancen – Auslegungsleitfaden (2003)
- Arbeitsdokument der Europäischen Kommission zu Natura 2000 (Dezember 2002)
- Prüfung der Verträglichkeit von Plänen und Projekten mit erheblichen Auswirkungen auf Natura-2000-Gebiete -Methodik-Leitlinien zur Erfüllung der Vorgaben des Artikel 6 Absätze 3 und 4 der Habitat-Richtlinie 92/43/EWG (November 2001)
- NATURA 2000 — Gebietsmanagement Die Vorgaben des Artikel 6 der Habitat-Richtlinie 92/43/EWG (2000)
Bund/ Bundesländer (übergreifend)
Länderarbeitsgemeinschaft Naturschutz (LANA)
- Anforderungen an die Prüfung der Erheblichkeit von Beeinträchtigungen der Natura 2000-Gebiete gemäß § 34 BNatSchG im Rahmen einer FFH-Verträglichkeitsprüfung (März 2004)
- Hinweise zur Anwendung des europäischen Artenschutzrechts bei der Zulassung von Vorhaben und bei Planungen (2006)
- Vollzugshinweise zum Artenschutz (Stand: 22.02.2007)
Länderarbeitsgemeinschaft Naturschutz (LANA) / Bundesumweltministerium (BMU)
- Inhalt und Auswirkungen des Urteils des Europäischen Gerichtshofs vom 10. Januar 2006 gegen Deutschland wegen nicht ausreichender rechtlicher Umsetzung der FFH-Richtlinie (Mai 2006)
Lambrecht et. al.
- Fachinformationssystem und Fachkonventionen zur Bestimmung der Erheblichkeit im Rahmen der FFH-VP (Juni 2007)
Kieler Institut für Landschaftsökologie
- Arbeitshilfe Vögel und Straßenverkehr (April 2010)
- Vögel und Verkehrslärm, FuE-Vorhaben des BMVBS, Schlussbericht (November 2007)
Bund für Umwelt und Naturschutz (BUND) / Naturschutzbund Deutschland (NABU)´
Bundesministerium für Verkehr, Bau und und Stadtentwicklung (BMVBS)
- Leitfaden zur Berücksichtigung des Artenschutzes bei Aus- und Neubau von Bundeswasserstraßen
- Leitfaden zur FFH-Verträglichkeitsprüfung im Bundesfernstraßenbau (2004)
- Gutachten zum Leitfaden zur FFH-Verträglichkeitsprüfung im Bundesfernstraßenbau (2004)
Bundesamt für Naturschutz (BfN)
Eisenbahnbundesamt (EBA)
- EBA-Umweltleitfaden zur eisenbahnrechtlichen Planfeststellung Teil I – Übersicht (07/2010)
- EBA-Umweltleitfaden zur eisenbahnrechtlichen Planfeststellung Teil IV – FFH-VP (07/2010)
- EBA-Umweltleitfaden zur eisenbahnrechtlichen Planfeststellung Teil V – Artenschutz (06/2010)
- EBA-Wirkungsprognose (11/2006)